Озон не оставляет вредных побочных продуктов и является экологически безопасным. Неиспользованный озон переходит обратно в более стабильную форму кислорода в течение нескольких десятков минут.

После озонирования вода может быть использована повторно, что совершенно безопасно, или сбрасываться непосредственно в окружающую среду.

Озонирование воздуха в 1,5-5 раз эффективней, чем обработка УФ лампами, в тоже время при озонировании затраты энергии в 6 раз меньше, чем при очищении ультрафиолетом.

Озоновые генераторы могут быть сделаны очень компактно. Озон генерируется на месте и избавляет пользователя от необходимости транспортировать, хранить и выполнять формальности, как в случае с хлором и другими химическими веществами.

Озон может быть получен из окружающего воздуха и единственным требованием является доступность источника электропитания. Небольшие генераторы озона могут располагаться на салазках вместе с портативным электрическим генератором. Это делает озонаторы очень мобильными и позволяет использовать озон в более, чем одном месте и для различных целей. К примеру, один генератор озона можно по очереди использовать для санации разных помещений, а также обработки тары и инвентаря, воды.

Помимо первоначальных инвестиций на приобретение и развертывание системы озонирования, генераторы озона влекут гораздо более низкие накладные расходы по сравнению с другими способами обработки (требуются только типичные расходы для обслуживания оборудования).

Расчёт требуемой производительности озона,  а также привязка озонатора к месту часто является сложным процессом. Иногда может потребоваться даже реализация пилотного проекта по озонированию для проведения тщательного исследования. Пилотный проект позволяет учесть все факторы, влияющие на процесс озонирования и провести точные расчёты для проектирования рабочей станции. Это позволяет максимально эффективно использовать технологию озонирования.