Бактерії та плісняві грибки виробляють токсини, які створюють загрозу здоров’ю тваринам. Обробка кормів озоном дозволяє значно знизити наявність у них мікрофлори та токсинів, підвищує біологічну цінність кормів.
Обробка озоном кормів у бункерах дозволить запобігти гниття кормів та зростання плісняви.
Озон також використовується для підготовки питної води для сільськогосподарських тварин та птиці з метою знезараження від патогенної мікрофлори, знешкодження токсичних речовин.